Os objectivos do ensino na USTM visam:
1. Desenvolver capacidades e atitudes nos graduados de aprenderem como aprender, que lhes possibilitem o desenvolvimento dos seus conhecimentos e capacidades ao longo da vida, de modo a procurarem a verdade, conservarem e comunicarem o saber para o bem da sociedade e para responderem com pertinência e qualidade às necessidades e demandas da sociedade;

2. Formar profissionais competentes, livres, criativos, autores de sua própria história, lideres na construção da sociedade, que assumam os valores da ética humanista na vida e na profissão;
3. Desenvolver as capacidades e atitudes éticos e investigativos na busca da verdade científica, e dar testemunho dos valores éticos em todas as dimensões da sua actividade e nos ambientes intelectuais e universitários, mediante o diálo¬go interdisciplinar, a solidariedade e a cooperação;
4. Capacitar os estudantes a procurarem, interpretarem e avaliarem os conhecimentos técnicos existentes de modo a aplicá-los na execução das suas tarefas profissionais para o bem da comunidade num espírito de servir e não ser servido;
5. Capacitar os graduados para desenvolverem atitudes e capacidades de integrar conhecimentos de várias disciplinas e de trabalhar em equipas multidisciplinares com espírito de auto-reflexão, inovador, crítico e análise.
Assim sendo, o ensino na USTM é especialmente orientado para a aplicação e integração da teoria com a prática de modo que os graduados sejam não procuradores mas criadores de empregos (not job seekers but job makers). Por isso, o ensino da USTM deverá ser inovativo, participativo, colaborativo e integrado, incentivando a autoconfiança.